海洋地质调查

承担公益性、基础性、战略性海洋地质调查工作；开展海洋基础测绘、遥感、地球物理探测工作，服务海洋与海岸带开发利用工作。承担海洋与海岸带空间规划、经济发展规划编制工作，开展海洋经济高质量发展要素研究工作。

海洋防灾减灾

承担海洋与海岸带灾害防治工作；开展海洋地质灾害与生物灾害调查评价、业务化监测、风险评估和技术研究工作，开展海洋数据信息化工作。负责自然资源部华东海岸带野外科学观测研究站建设运行。

盐碱地生态利用

承担滨海盐碱地生态改良技术研究和推广应用工作；开展耕地质量提升、滨海资源调查利用评价工作；开展滨海盐碱地可持续利用与标准化研究工作。负责自然资源部滨海盐碱地生态改良与可持续利用工程技术创新中心平台建设运行。

海洋生态保护修复

承担海岸带和海域海岛生态保护修复工作，开展海洋资源调查监测，服务海岸带与海域海岛管理；承担江河湖海生态调查监测，开展生态保护修复技术和碳汇技术研究；开展地质资源调查评价工作。负责自然资源部滨海盐沼湿地生态与资源重点实验室建设运行。

土壤污染防治

开展土壤污染防治工作，负责资源环境承载能力和国土开发适宜性评价、土地安全风险评估技术性工作。负责江苏省土壤污染防治工程技术中心平台建设运行。

分析测试研究

负责海洋、土壤、地下水测试分析；承担地质技术方法试验研究工作。承担海洋观测监测设备计量检定，负责江苏省海洋观监测仪器设备计量能力建设。